Bioinformatickí technici

Bežný pracovný deň

Technik bioinformatiky prichádza do laboratória s laptopom, na ktorom má nainštalované špecializované softvérové balíčky ako Bioconductor a Galaxy. Po stretnutí s kolegami, ktorí sa zaoberajú výskumom nových liekov, analyzuje dáta z genomických experimentov a pomocou skriptov v Pythone a R odhaľuje vzory v sekvenciách DNA, ktoré naznačujú genetické predispozície ku konkrétnym ochoreniam. Následne vykonáva kontrolu kvality vstupných dát a poskytuje spätnú väzbu výskumníkom, pričom navrhuje zlepšenia v databázovom spracovaní. Po obede sa zameriava na vývoj a údržbu databáz s proteínovými sekvenciami, pričom používa SQL na optimalizáciu dotazov. Na záver dňa pripravuje podrobnú správu o výsledkoch analýz pre konferenciu a prechádza novinky v oblasti bioinformatiky, aby bol informovaný o najnovších trendoch a technológiách.

Detailná náplň práce

• Analyzuje alebo manipuluje s bioinformatickými dátami pomocou softvérových balíkov, štatistických nástrojov alebo techník dátovej ťažby.
• Vykonáva kontrolu kvality vstupných dát a výsledných analýz či predpovedí.
• Sleduje nové a vznikajúce výpočtové metódy a technológie.
• Radí sa s výskumníkmi, klinickými pracovníkmi alebo IT pracovníkmi s cieľom určiť potreby dát a požiadavky na programovanie a pomáha pri výskume, ktorý pracuje s databázami.
• Zúčastňuje sa na príprave správ alebo vedeckých publikácií.
• Vyvíja alebo udržiava aplikácie, ktoré spracúvajú biologicky orientované dáta do vyhľadávacích databáz pre účely analýzy, výpočtu alebo prezentácie.
• Rozširuje existujúce softvérové programy, webové interaktívne nástroje alebo dopyty do databáz podľa vývoja potrieb správy a analýzy sekvencií.
• Zadá alebo získa informácie zo štrukturálnych databáz, databáz motívov bielkovinových sekvencií, databáz mutácií, genómových databáz alebo databáz expresie génov.